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三天后,在研究院的例行会议上,陆时羡特别表扬了智能计算中心的工作。
而智慧剪刀1.0系统,很快就在研究院内部推广使用,成为研究人员设计基因编辑实验的重要工具。
金秋十月,距离张封正式以特聘首席科学家身份加入繁缕研究院已过去半年。
在这段时间里,他那独特的跨太平洋工作模式不仅没有成为阻碍,反而意外地成为了连接东西方科研前沿的高效桥梁。
而在他深入参与和全力推动下,国家生命设计大科学装置项目如同装上了强劲的引擎,以超乎预期的速度完成了第一期基础建设,并顺利进入了以系统集成与核心功能实现为目标的第二期阶段。
这一天,燕北科学城项目现场,一场别开生面的阶段性成果汇报会正在举行。
与以往在会议室里看ppt汇报不同,陆时羡和张封直接将与会的各部委领导、评审专家带到了已然初具规模的装置现场。
穿过严格的风淋室,众人眼前呈现的是一个充满科技感的自动化世界。
数以千计的实验模块在精密轨道上无声滑行,机械臂以令人眼花缭乱的速度进行着移液、分选和检测操作。
这里目前每天可以并行完成超过一百万次微观生命实验。
陆时羡向参观的领导介绍道,语气中带着自豪:这不仅仅是规模的扩大,更是研究范式的革命。
我们利用智能编辑器技术,实现了对实验条件的实时优化和主动探索。
他指着大屏幕上实时跳动的数据:比如,在过去三个月里,我们系统性地扫描了枢纽蛋白hSF1在不同应激条件下的调控网络,发现了三个全新的调控靶点,这个过程如果依靠传统实验室模式,需要耗费数年时间。
走进一个布满特殊屏蔽材料的暗室,中央是一台造型奇特的巨大设备,其核心是一个由多束激光交汇形成的透明观测区。
这是我们与麻省理工学院mediaLab联合改进的‘活细胞全景成像仪’。
陆时羡解释道,它能够在保持细胞存活的前提下,以纳米级分辨率和秒级时间精度,同时对细胞内超过两百种生物分子进行动态追踪。
为了展示效果,他示意操作员调出了一段震撼的视频:一个免疫细胞正在识别并吞噬病原体的全过程,细胞内部骨架蛋白的重组、信号分子的传递、囊泡的运输,所有细节一览无余,仿佛将一部微观世界的史诗大片呈现在众人眼前。
人群中,一位来自科学院的资深院士看得目不转睛,连连感叹:这简直是给了我们一双洞察生命过程的‘神之眼’!
随后,众人来到生物分子智能设计平台。
这里算是智慧剪刀1.0系统与自动化实验平台深度耦合的典范。
在巨大的实验大厅里,几乎看不到研究人员的身影,只有设备运行的微弱嗡鸣。
陆时羡亲自进行讲解:基于张封教授带来的前沿理念和我们自主研发的设计引擎,这个平台已经实现了从‘靶点识别’到‘功能验证’的全程自动化。
大屏幕上展示了一个最新案例:针对一种罕见遗传性神经疾病,平台在接到任务后,72小时内就完成了致病基因突变分析、候选修复方案的设计、以及超过五千种候选编辑器构效关系的评估,并自动筛选出了最优的编辑策略,目前已在细胞模型中验证取得了理想效果。
“这个速度,意味着我们对许多疾病的研究和干预,将不再是以‘年’,而是以‘天’为单位。
陆时羡的话在现场引起了不小的震动。
虽然部分区域还在进行最后的调试,但其庞大的规模和处理能力已经可见一斑。
巨大的机房内,闪烁着幽蓝光芒的机柜整齐排列,专用的生物信息处理单元正在高速运转。
在成果汇报会的一片赞誉声中,但是陆时羡还是在当晚的项目组核心会议把项目目前遇见的难题提了出来。
各位领导,各位同仁。
白天的演示很成功。
但有一个问题,我必须立即汇报,‘生命信息超算枢纽’的冷却系统,已经接近设计容量的极限了。
会议室里轻松的气氛为之一凝。
黎平安眉头微蹙:仔细说。
陆时羡打开投影,调出了实时的系统监控数据。
我们为了处理海量的生物信息,特别是调控网络所需的大规模并行计算,定制了超过十万个专用生物信息处理单元。
这些芯片在全力运算时,其单位面积的热功耗,是传统通用服务器的三到五倍。
屏幕上显示出令人心惊的曲线图,过去一周,核心机柜区域的温度,尤其是在午间计算高峰时,已经多次触及系统设定的黄色警报线。
我们现有的液冷系统,已经是业界顶尖水平。
陆时羡继续解释,语气有些无奈。
但生物计算负载的突发性和不均衡性太强。
比如,当进行全细胞动态模拟时,算力需求会在几分钟内飙升,产生的热量瞬间爆发,冷却系统根本来不及响应。
他展示了一段红外热成像视频,可以看到在计算峰值时,部分机柜区域亮起了代表高温的刺眼红色。
长此以往,不仅会严重影响芯片寿命和计算稳定性,更现实的风险是我们不敢让整个系统满负荷运行。”
“这意味着,我们花巨资打造的这个‘大脑’,暂时还戴着一副无形的‘枷锁’。
考核组组长陈清文身体前倾,表情严肃:这个问题必须解决。
我看你们下一阶段计划进行的全组织尺度模拟,预计对算力的需求将是现在的十倍以上。”
“如果散热问题不解决,整个项目的进度都会受到致命影响。
陆时羡沉默了片刻,手指轻轻敲击着桌面。
取得成绩的背后,并不总是一帆风顺。
这恰恰说明了攀登科学高峰的道路上,每一步都会遇到新的、意想不到的挑战。
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